La presencia de la Congregación Hijas de Santa Ana en el Cusco, tiene su origen un 27 de noviembre de 1887, como uno de los anhelos de la fundadora Beata Ana Rosa Gattorno de llegar a tierra Americana, el cual se realizó a través de sus hijas, quienes a su arribo al Perú, acudieron al llamado de la Beneficencia Pública del Cusco, desplegando así sus primeras acciones al servicio de los enfermos, obra predilecta de la Madre Fundadora. En 1893 se inaugura en forma silenciosa, una escuela que posteriormente iría creciendo hasta convertirse en 1939 en el Colegio Santa Ana, brindadndo servicios en Educación Primaria, Jardín de Infantes, Secundaria Común y Comercial.
La permanencia en el local de Santa Catalina fue casi de 90 años; la infraestructura ya no respondía a las necesidades y exigencias del estudiantado, ni a los ideales de la educación; por ello hace más de dos décadas, cuenta con un local amplio, con una infraestructura única y moderna con aulas implementadas con equipos multimedia, campos deportivos, gimnasio, Auditorio, Laboratorio de Ciencias, Biblioteca, laboratorios de Cómputo y otros, en los cuales se brindan además Talleres Extracurriculares como Música, Danza, Deporte y Liderazgo aneño al servicio de nuestras estudiantes ubicados en la Urbanización Santa Rosa.
Son muchas las hermanas que dirigieron este Centenario Colegio como: Sor Ana Morel del Pueblo, quien fue la propulsora de esta obra; esta la fuerza vivificante de Sor Ana Santina Lomónico, gran impulsadora y constructora del antiguo local; Sor Ana Rosario Menichini; Sor Ana Mariana Ceccoli; Sor Ana Agnese Rusconi y en el nuevo local tuvo la fuerza y dinamismo Sor Ana Leonor Antonieta Ruiz Raffo; Sor Ana María Rodriguez; Sor Ana Bertha Olaya Morales; Sor Ana Victoria de la Torre; Sor Ana Blanca Altamirano; Sor Ana Hilda Elena Arpa Calachua; Sor Ana Leonor Antonieta Ruis Raffo; Sor Ana Flor de María Jáuregui Dextre; Sor Ana Hilda Elena Arpa Calachua y Sor Ana Teresa de Jesús Távara Rojas actual Directora de nuestro querido Colegio.
Su historial esta revestido de innumerables logros en el campo de la Educación, la Cultura, el Deporte y otras actividades donde han sobresalido nuestras estudiantes demostrando la sólida formación integral que se les imparte. También son muchas las generaciones de mujeres exitosas que el Colegio ha dado a la sociedad Cusqueña, Nacional e Internacional, que destacan nítidamente con su responsabilidad, entrega e identidad Aneña a nivel familiar y profesional.
